本病应与腹股沟淋巴结肿大相关疾病鉴别。

1. 梅毒性横痃 生殖器部位有硬性下疳，腹股沟淋巴结呈孤立性肿大，坚硬，不融合，不破溃，不痛，梅毒血清反应阳性。

2.软下疳 横痃疼痛明显，破溃后不形成瘘，病程短，原发病损中可查到杜克雷杆菌。

3. 化脓性淋巴结炎 发病急，病程短，邻近组织有外伤感染灶，无性病史。

1.生殖器疱疹：此病与性病性淋巴肉芽肿的鉴别见表1。
表1性病性淋巴肉芽肿与生殖器疱疹鉴别

性病性淋巴肉芽肿生殖器疱疹数目1-2很少多发数个部位冠状沟，系带不定溃疡较深，暗红色表浅性小水泡糜烂，鲜红色浸润多半可见无——有自觉症状无疼痛或灼热感感染机会有无既往史无多再发横痃性病性淋巴肉芽肿无病原体衣原体单纯疱疹病毒
2.硬下疳：梅毒性腹股沟淋巴结炎质硬、不痛、不破溃，可发现梅毒螺旋体而区别之。

3.软下疳：腹股沟淋巴结炎较痛，脓液较多，病原检查则为杜克雷嗜血杆菌。
各种性病淋巴结炎的鉴别
项目性病性淋巴肉芽肿梅毒软下疳病原体衣原体梅毒螺旋体杜克雷杆菌潜伏期1天21天3-5天分布1或2侧两侧1或2侧数目多发数个单或多发大小鸡蛋或更大拇指大鸡蛋或更大疼痛 - 红肿化脓 - 沟槽征 - 多瘘管 - 全身症状 - 梅毒血清反应试验- -

本病诊断有赖于病原体的分离及血清学的检查，基因诊断对于确立该病十分重要。

1.衣原体培养：抽取有波动的淋巴结内的脓液接种于小鼠的脑组织或鸡胚卵黄囊或McCoy细胞（细胞已取代前二者）可分离出病原，但敏感性不高。

2.血清学检查：目前最有帮助的血清学方法是补体结合试验。本试验很敏感，于感染4周后出现阳性，当查到高水平抗体（1：64）时有诊断意义。但本试验对性病性淋巴肉芽肿并无特异性，仍要结合临床进行分析。

3.微量免疫荧光试验及酶联免疫吸附试验，亦已被应用，它们有一定的敏感性和特异性，可用于鉴别及筛选用。

4.基因诊断。