本病的病原菌是念珠菌，该菌是一种由出牙生殖的酵母状真菌。已知念珠菌属可以致病的有：白色念珠菌、热带念珠菌、假热带念珠菌、克鲁斯念珠菌、星状念珠菌、吉利蒙念珠菌和采兰若念珠菌等八种。念珠菌不仅广泛存在于自然界里，而且也可以寄生在正常人体皮肤，口腔、胃肠道、肛门和阴道粘膜上而不发生疾病，是一种典型的条件致病菌。

多数的念珠病可能是内源性引起的。促使该病发生的因素很多，最主要的有下列几种情况：如糖尿病，肺结核，肿瘤，严重烧伤，脏器移植等患者均能使机体抵抗力降低而容易发生念珠菌感染；长期大量应用广谱抗生素可出现菌替代现象或菌替代症，即使用抗生素后可能引起体内对抗生素敏感的菌群受到抑杀，而某些菌群象念珠菌对抗生素不敏感，则有耐药性的菌株反日益增殖，从而破坏了体内细菌群间拮抗平衡；长时间使用皮质类固醇激素和免疫掏剂也可招致机体免疫功能下降而有利于念珠菌的感染。

除上述以外，外源性感染也不可忽视，即念珠菌病可由接触外界菌体而受染。如男性念珠菌性龟头包皮炎，往往是从其妻有念珠菌性阴道炎传染所致的；哺乳期妇女的乳头皮肤念珠菌病，多数来自患有鹅口疮，也常由其母亲患念珠菌性阴道炎所引起的；双手经常浸水的职业，如再接触念珠患，亦容易引起本病。

随着现代医学进步，各种脏器移植术，心脏外科以及各种导管技术开展，本病发病率有日益增多的趋势，故值得今后引起注意。