儿童鼻窦炎由于症状不明显，患儿不知主诉，加上检查时不易配合，有时症状的出现常为并发症，为此在诊断方面较成人更为困难。其诊断也主要是依靠病史和检查。
(1)详细询问病史：在孩子患感冒1周以上，经治疗鼻塞、流涕等症状未见减轻反而加重，鼻塞及黄脓涕增加，应考虑有鼻窦炎的可能。(2)全身症状较成人明显：如急性鼻窦炎可有发高烧及中毒症状，甚至出现脱水、抽搐，有时可有恶心、呕吐、咳嗽等，慢性鼻窦炎可有低热、精神不振、食欲欠佳、体重下降、记忆力差等症状。(3)鼻腔及局部检查：急性鼻窦炎时，鼻窦邻近软组织的红、肿、压痛及鼻涕倒流入咽部的现象较成人多见，鼻腔检查非常重要，可用小儿鼻镜作前鼻孔检查，急性鼻窦炎鼻腔粘膜呈急性充血、肿胀；鼻腔内蓄有大量脓涕，鼻涕倒流入咽部等现象较成人为多见，必须配合咽部检查，以观察咽后壁处有无脓涕从鼻后孔流下。慢性鼻窦炎则可见鼻前庭结痂，小儿下鼻甲肥大，用1%麻黄素液收缩下鼻甲后检查，则可见到中鼻道及嗅沟处有脓液积聚，检查时应注意鼻底、鼻后部、中鼻道及嗅沟粘膜有无脓液及红肿，或鼻顶部有无息肉。(4)X线摄片及CT扫描：X线摄片对5岁以下的小儿鼻窦炎诊断意义不大，须与临床症状、体征及病史结合方有参考价值，稍大儿童可见窦腔混浊，有液平面，粘膜增厚超过4mm，或有息肉或有粘液囊肿。A型超声波检查及CT扫描对于诊断儿童鼻窦炎有较好的价值。(5)其他如透照法及上颌窦穿刺冲洗法仅适用于较大的儿童。