子宫内膜异位病灶生长缓慢，妊娠期常发生退变，绝经后停止发展，故一般预后较好。如病变范围过于广泛，或肠道受侵，则可能发生肠梗阻这一严重并发症。



子宫内膜异位症很少并发妊娠，妊娠后亦易发生流产、早产或输卵管妊娠。



子宫内膜异位症的手术治疗效果均较理想。年轻患者且可再次恢复生育功能。子宫内膜异位症恶性机率很小。

子宫腺肌病患者不再有生育要求者，以全子宫切除为好，尽量保留卵巢。如合并盆腔子宫内膜异位症者，也尽可能切除病灶而保留卵巢功能，使患者走向自然绝经。要求生育者，可用激素治疗6～12个月，停药扣希望能在短期内受孕。如系在手术探查时发现，应考虑切除腺肌瘤而保留子宫。

继发性逐渐加重性痛经，发生在中年生育期妇女，应考虑有子宫腺肌病。如伴有月经过多，经期过长，子宫增大，更应考虑子宫腺肌病。子宫碘油造影可见在一处或数处进入肌壁，形成憩室状影，但其阳性率只有20左右。最终诊断还靠子宫大体和病理组织学检查。

子宫腺肌病（adenomyosis），又称内在性子宫内膜异位症，为子宫内膜侵入子宫肌壁层，属于子宫内膜异位症的一种特殊型，可以和“外在”或主要是盆腔子宫内膜异位症同时存在。子宫内膜可以两种形式侵入子宫肌壁层，即弥漫型和局限型。前者为异位内膜侵入整个子宫的肌壁内，在不同部位其侵入范围和深浅可不同；后者异位内膜仅侵及某部分肌壁，形同子宫肌瘤，但其与周围正常组织并无分界（假包膜）。