肺炎支原体可以感染肺外组织 因此在发生肺炎期间可以出现其他的肺外症状，如皮肤损害 神经系统损害、心血管系统损害、消化系统损害 胸膜病变等。极少数病例可伴发中枢神经症状 例如脑膜炎、脑膜脑炎、多发生神经根炎 甚至精神失常等。出血性耳鼓膜炎、胃肠炎 关节炎、血小板减少性紫癜、溶血性贫血 心包炎、心肌炎、肝炎也有发现 　

　　泌尿支原体感染常见的合并症为输卵管炎 少数患者可出现子宫内膜炎及盆腔炎。