1 细菌性痢疾 典型菌痢有高热、腹痛腹泻、泻脓血便 腹痛在下腹或左下腹，左下腹明显压痛，且有肠索 伴明显里急后重。粪检有较多脓细胞、吞噬细胞 重者常脱水。这都有利于和本病区别。

　　2 其它细菌所致腹泻，如鼠伤寒、致病性大肠杆菌 耶氏菌、亲水气单胞菌，其他厌氧菌等 单从临床有时很难鉴别。怀疑时应依靠病原学和血清学来确诊。

　　3 肠道外感染者须与沙门菌病及布氏菌病鉴别。