小儿外科是医院临床重点科室之一，拥有国内一流小儿外科技术力量和现代化的诊疗设备。现有教授2名、副教授3名，博士3名、硕士2名。配备有进口尿流/肛肠动力学检查系统、肌电检查/诱发电位/术中监护系统、小儿膀胱镜生物、大小便失禁生物反馈治疗仪及心电监护仪等设备、仪器。
学术带头人陈雨历教授是太平洋小儿外科医师学会委员，中华小儿外科杂志副总编，山东省医学会小儿外科委员会主任委员。40年来一直从事医疗、教学和科研工作，全面掌握小儿外科领域的现代医学理论知识和临床诊治技能。特别在小儿大小便失禁、小儿普通外科、小儿泌尿和肛肠外科等方面均有独到的建树，先后设计、独创、改进和开展了数十项手术和新技术，曾获省科委科学技术进步二等奖二项。科主任李金良教授，是医学博士，中华医学会小儿外科委员会中青年委员，硕士导师。长期从事小儿外科临床和科研、教学工作，对小儿腹部外科、泌尿外科、骨外科及胸外科、新生儿外科多种疾病的治疗有独到的见解，特别是对先天性脊柱裂的诊治方面。
　　科室可进行小儿外科各亚专业中各种常见病和疑难、少见疾病的诊治，能施行各种小儿普通外科、小儿泌尿外科、小儿骨科及小儿胸外科手术治疗，治疗水平与疗效始终走在国内的前沿。
　　科室是国内唯一的小儿大小便失禁研究中心，诊断与治疗水平居全国领先、国际先进。其内容包括小儿神经原性膀胱和神经原性肛肠的功能重建手术治疗、保守治疗与康复治疗与训练，各种功能性疾病引起的大小便失禁或排尿、排便困难的保守治疗与生物反馈治疗，各种先天性和后天性肌原性大便失禁的括约肌重建手术治疗。近年来又开展了先天性脊椎裂的病理学和临床诊断治疗研究，是国内少数几个率先开展小儿显性脊柱裂、隐性脊柱裂脊髓松解、占位病变切除等椎管内干预手术的研究小组之一，并且诊治病例数量最多，治疗结果达到了国际先进水平，使尚未发生脊髓损害者不再发生脊髓损害，有脊髓损害症状者不再加重并有不同程度的恢复。
　　经肛门结肠拖下手术是目前国内外推崇的非内镜微创治疗先天性巨结肠的最新方法，优点是腹部无刀口、创伤小、术后恢复快、手术并发症少，治愈率几乎接近100%。该科室是国内第一批开展此手术的医疗中心之一，将此项技术应用于先天性和后天性肛门狭窄、继发性巨结肠、先天性肛门闭锁等疾病的治疗，取得了良好的效果。此外，还应用腹腔镜、膀胱镜等进行多种疾病的内镜诊断及微创治疗治疗。近年来又开展了多种不用内镜的微创手术，如经脐手术治疗先天性卵黄管疾病、肥厚性幽门狭窄等，又如小切口免缝手术治疗小儿腹股沟疝和鞘膜积液等等。