福建医科大学附属第二医院口腔科创建于五十年代末，历经沧桑，人才外流，曾一度濒临闭门。近十年来，在院领导的支持下，不断接收上海第二医科大学、福建医科大学、中山医科大学的本科毕业生，从一个两人的小科室发展成为一个技术力量强、专业齐全、设备完善的口腔专业综合科室。口腔科目前拥有主任医师1名、副主任医师1名、主治医师2名、住院医师1名、技术人员及专业护士各1名，分为口腔内科、口腔修复科、口腔正畸科和口腔颌面外科4个分支专业。口腔门诊目前拥有美国进口的爱迪克口腔综合治疗床6台、法国trophy口腔牙片机、法国esp光固化机、意大利ems洁牙机、微波口腔治疗仪以及各种进口牙科治疗、美容、修复、正畸材料。我科门诊目前可为患者提供：牙科病治疗、牙周病治疗、光固化美容修复、超声洁牙、牙列不齐矫正、缺牙修复、金属铸造支架活动义齿、烤瓷冠桥修复、牙槽手术、儿童牙病的治疗及口腔预防保健等服务。我科门诊配有牙科消毒机、诊疗器械均经有效消毒，避免疾病的“交叉感染”。
　　我科除了担负医疗任务外，还承担着福建医科大学成教学院口腔系、漳平卫校、泉州卫校等院校的临床实习教学，每年还接受基层医院的进修人员，增加了医院在各地市的影响，扩大了病人的来源。
　　我科在狠抓医疗质量，开展优质服务的同时，非常注重业务水平的提高。先后有三人赴上海、北京进修学习，引进了国内最先进的口腔正畸矫治技术（包括固定、活动、功能性矫治等），开展了儿童期各种颌骨生长发育畸形的早期生长发育引导性矫治、青少年牙列不齐、前牙前突、反咬合等各种一般牙列畸形和疑难病例的正畸矫治等业务。我科逐渐开展的弹性义齿、精密附着体、套筒冠、贵金属烤瓷冠、钛合金铸造支架等业务均是国内较先进技术。
　　近年来，我科颌面外科门诊也拓宽了服务范围，开展了颌骨骨折内、外固定术、各种囊肿根治术、三大腺体的各种疾病手术、埋伏牙拔除术、唇面部整形术、血管瘤手术及保守治疗、齿槽修复整形等业务。