江苏省中医院于1955年起设置中医喉科，于1972年起设置中医耳鼻咽喉科。在1955年至1977年，科室只有1个门诊诊疗室，配备医生2～3人。1978年起，科室人员开始逐渐增加。至1984年，科室初具规模，有门诊诊疗室4间，医生8人，护士1人， 1999年通过专家验收确定为全国中医耳鼻咽喉科医疗中心。2002年9月被国家中医管理局确定为全国唯一的中医耳鼻咽喉科重点专科建设单位。1990年起耳鼻咽喉科开设病房。 
　　目前耳鼻咽喉科门诊面积为300余平方米，其中包括门诊诊察室、检查室和治疗室等；病房床位22张，每年收治耳鼻咽喉科疾病约120余种；实验室面积18平方米，具有脑干电位测听仪、计算机嗓音分析仪等先进的临床实验仪器设备。 
　　耳鼻咽喉科现有医生16名，其中主任医师5名（聘任3名），副主任医师8名（聘任5名），主治医师5名（聘任4名），住院医师5名，护士 10名，目前耳鼻喉科已形成较为良好的人才梯队。 耳鼻咽喉科的硬件设备不断完善，目前配有电脑自动测听仪、声阻抗测听仪、脑干电诱发电位测听仪、纤维喉镜、电脑嗓音分析评估仪、电脑声门电图仪、鼻腔-鼻窦内窥镜、蔡氏手术显微镜、YAG激光治疗仪、微波治疗仪、电脑声频治疗仪等万元以上的大型设备14台。 中医耳鼻咽喉科的优势和其他各科一样，主要是整体观念、辨证论治，多年来，我们注重发挥这种优势，对一些难治病种进行攻关，取得了明显的成效，并吸收了全国各地的大量病员前来就诊。 
1.慢性咽炎：总结、开发干祖望教授的经验方"慢性咽炎1号"、"慢性咽炎2号"、"慢性咽炎3号"，治疗慢性咽炎，使疗效达到90％以上。
2.突发性聋：总结、开发干祖望教授的经验方"还聪丸"，治疗突发性聋，使疗效达到80％以上。
3.过敏性鼻炎：在"鼻敏合剂"的基础上，开发"鼻敏颗粒"，治疗过敏性鼻炎，使疗效达到70％以上。
4.慢性喉炎、声带小结：研究开发"润喉开音片"、"开音颗粒"，治疗慢性喉炎、声带小结，使疗效达到85％以上。

5.喉源性咳嗽：总结、开发干祖望教授的经验方"喉咳宁"，治疗喉源性咳嗽，使疗效达到80％以上。
我科还坚持搞好耳鼻咽喉科重点疾病的专病门诊，现有的"嗓音病"、"过敏性鼻炎"、"口腔溃疡病"等专科门诊已开设多年，在临床疗效上具有国内领先水平。目前尚在酝酿增设"耳聋耳鸣"、"眩晕"、"鼻窦炎"、"分泌性中耳炎"、"慢性咽炎"等特色专科门诊，在总结提高临床疗效的基础上，开发特色新制剂。同时，专科门诊与科研课题相结合，与国内（省内）的协作网络相结合，通过科研和学术交流，不断提高诊疗水平。
早在50年代，江苏省中医院治疗耳鼻咽喉科疾病的特色制剂就名扬全国，如干祖望的"五味子合剂"成为上海医科大学附属眼耳鼻咽喉科医院的常用制剂，黄冕群的"响声丸"更是知名度很高的中成药。
在各级领导的重视下，经全科人员的共同努力，我科的科研工作有了长足的发展。我科主持的科研课题共15项，其中国家级课题1项，部省级课题3项，厅局级课题11项，得到科研经费30余万元，完成课题4项，获得江苏省中医管理局科技进步奖2项。具体如下：
（一）目前承担的科研课题有：
1.氨基糖甙类抗生素中毒性耳聋中医肾虚学说研究，江苏省科委课题；
2.中医耳鼻咽喉科学音像教学研究，江苏省教委课题；
3.变应性鼻炎化学介质与中医辨证关系的研究，国家自然科学基金课题；
4.变应性鼻炎中医辨证指标的研究，江苏省科委课题；
5.鼻敏合剂治疗变应性鼻炎的研究，江苏省中医管理局课题；
6.脉络宁拮抗庆大霉素耳蜗毒性的实验研究，江苏省中医管理局课题；
7.慢性鼻炎证的病理生理学研究，江苏省中医管理局课题；
8.慢性咽炎证的客观化研究，江苏省中医管理局课题；
9.中医耳鼻咽喉科学CAI教学软件的研究，江苏省教委课题；
10.鼻敏颗粒剂治疗常年性变应性鼻炎的临床和实验研究，江苏省中医管理局课题；
11.清咽袋泡剂治疗慢性咽炎的临床和实验研究，江苏省中医管理局课题；
12.干祖望学术思想研究，江苏省中医管理局课题。
（二）已经完成的课题有：
1.养阴生肌膜治疗口腔溃疡的研究，1997年获江苏省中医管理局科技进步一等奖；
2.润喉开音片治疗慢性喉炎、声带小结的研究，1997年获南京中医药大学优秀科技成果奖，1998年获江苏省中医管理局科技进步一等奖。
3.五官科见习教学改革研究，1996年获南京中医药大学教研成果三等奖
4.活血化痰法治疗慢性喉炎、声带小结的研究，国家中医药管理局课题，完成任务，已申请鉴定。
5.鼻敏合剂治疗变应性鼻炎的临床和实验研究,江苏省中医管理局课题,临床部分完成,1999年获江苏省中医院科技成果三等奖.
90年代以来，我科在各种刊物发表的论文有120余篇，其中最近3年来，发表的有60余篇。