专业病理主要方向有：肾脏活检病理、淋巴造血系统病理（包括骨髓活检）、妇产科病理、软组织病理、呼吸系病理、消化系病理、移植病理以及细胞病理学等，其中一些专业在国内享有很大的知名度，肾脏活检和淋巴瘤、骨髓活检接受来自全国的会诊。
　　北大医院病理科创建于1912年，当时为北京医科专门学校病理教研室的分支部门。1958年病理科独立，时任主任为马文香医生，全科共5个医技人员。之后病理科不断发展壮大，高惠珍、唐素恩、陈梅龄、李竞贤、邹万忠等知名教授曾先后担任病理科主任。目前北大一院病理科已成为由北京大学医学部病理系牵头的国家211工程、重点学科点的主要组成单位。北大医院是国内一流的综合性大医院，病理科标本量大（目前年外检量19,000例，细胞学3,000例），疑难病例多是为基本特点，科内拥有高水平的病理技术和诊断，以及科研工作的人才队伍。目前科室在编人员共17人，有博士生导师、教授1名，享受政府特殊津贴、主任医师4名、副主任医师2名，主治医师2名，住院医师2名，上述医生队伍，硕士以上学位者占90%，多数曾在国外进修或取得博士学位。技术队伍有副主任技师1名，主管技师2名，技师2名，技士2名，其中大专以上学历者占90%。另外常年的日常工作、科研和教学还有研究生（2-4）、进修生（4-8人）和本科生（2-4人）等10人以上参与。目前病理科在600平方米的空间环境中，拥有包括自动脱水机（3台）、自动染色机（1台）、自动封片机（1台）、半自动切片机（1台）、冰冻切片机（3台）等全套现代化设备的常规大病理量病理切片制作技术室、广泛开展各种细胞标记和肿瘤标记、染色结果优良稳定的免疫组织化学实验室、设备完善并能进行多种用于研究和诊断的分子生物学实验技术的分子病理实验室、密集架形式并能存储往后20年左右病理资料（包括纸质、病理切片和蜡块）的病理档案室，以及多头显微镜、电视显象会诊室等。病理档案已经实现计算机数字化管理，病理图文报告系统等。正在完善从经典病理学科向以形态学分析为基础，进一步运用分子及细胞标志分析，数字化处理，全方位信息交流的现代诊断病理学科的发展转化过程。
　　本科在大标本量、高质量的常规临床病理诊断的基础上，历年来承担过多项科研课题，其中包括国家七五功关课题（陈梅龄）、国家863课题（陈梅龄）、国家自然科学基金课题（陈梅龄、邹万忠、李挺）、卫生部课题（邹万忠）、卫生部优秀青年人才基金课题（李挺）、教育部教育振兴行动计划专项基金（985工程李挺）、国家教委（尹洪芳）和本院科研课题（柳萍、尹洪芳、董颖）。目前承担的教学任务有研究生诊断病理学基础课、实习本科生临床病理学选修课程、常年进修生系统病理课程以及北京市和北京大学住院医师病理学培训等。发展的专业病理主要方向有：肾脏活检病理、淋巴造血系统病理（包括骨髓活检）、妇产科病理、软组织病理、呼吸系病理、消化系病理、移植病理以及细胞病理学等，其中一些专业在国内享有很大的知名度，肾脏活检和淋巴瘤、骨髓活检接受来自全国的会诊。本科人员在专业团体中的兼职有：北京市医学会病理专业委员会委员，中华肾脏病理杂志、诊断病理学杂志、实验与临床病理学杂志、肾脏病与透析肾移植杂志、北京医科大学学报等编委，肿瘤防治杂志编委，中华病理学杂志特邀审稿人等。