西藏军区总医院前身是川东军区直属医院，１９４
９年１１月组建于重庆市长寿县，１９５５年更名为陆军第４９医院，同年奉命进藏。１９６２年被命名为西藏军区总医院，并迁入现址。医院占地面积约４１万余平方米，建筑面积７万余平方米；编制床位４００张，现展开床位５５０张；编制于部、战士５５０人，现有６４５人；设有４部机关，１４个行政科室，２９个临床、医技科室。