广州市第二人民医院前身是美国基督教长老会于1899年12月12日创办的广东女医学堂赠医所，创始人是美籍人富马利博士。医院已走过了百年的历程，经过数代人的辛勤耕耘，已成为集医疗、教学、科研、预防为一体的“三级甲等”综合医院。1996年以省内首家试点单位通过临床教学医院的评审。1997年成为广州医学院附属市二人民医院。1998年广州市重症孕产妇救治中心设在该院。

　　医院在各级领导的关怀和支持下，在全体职工的共同努力和社会各界、国内外热心人士的大力支持下，近几年来取得了显著的成绩：1994年被评为“三级甲等”医院；在广州市市属医院中首家被卫生部评为国家级爱婴医院；是广东省卫生厅评定的首个临床住院医师规范化培训基地；1997年被定为广州医学院附属市二人民医院；荣获“全国卫生系统先进集体”、“广东省文明医院”、“广东省百家文明医院”、“广东省职业道德建设先进单位”、“广州市卫生系统最佳服务单位”等光荣称号。