1990年有人用高敏感的检查方法报道在抗甲状腺抗体阳性的妇女中，其前三个月流产率加倍。当有持续升高TSH水平的妇女被排除时，这种增高的发病率持续明显发生。这些病人没有不成比例的抗心磷脂抗体（被发现与高发的流产性相关联）。同样在缺碘地区也有类似的情况。近年来研究强调甲状腺抗体阳性是临床流产的危险因素。生化性妊娠流产的发病率可能不高于控制的滴度。目前这些发现是自身免疫导致流产的标志而不是流产原因。